Ham petrol ile kirlenmiş topraklardan petrol parçalayan bakterilerin izolasyonu, moleküler karakterizasyonu ve petrol bozunma potansiyellerinin belirlenmesi

Bu çalışma, ham petrol ile kirlenmiş topraklardan petrol parçalayan bakterilerin izolasyonu, moleküler düzeyde karakterizasyonu ve petrol bozunma potansiyellerinin belirlenmesi amacıyla yapılmştır. Toprak örnekleri, Azerbaycan’dan temin edilerek ham petrol ile kontamine edilildikten sonra çalışmalar gerçekleştirilmiştir. Laboratuvar çalışmalarıyla bakteri izolasyonu prosedürüne uygun çalışmalarla izole edilen bakteriler, morfolojik ve biyokimyasal analizlerin ardından moleküler tanımlama amacıyla DNA izolasyonu ve PCR teknikleri ile incelenmiştir. Ayrıca bakterilerin petrol bozunumu üzerindeki etkileri spektrofotometrik ölçümler ile değerlendirilmiştir. Elde edilen bulgular, ekolojik açıdan sürdürülebilir biyoremediasyon yaklaşımlarında bu bakterilerin potansiyelini ortaya koymaktadır. Çalışmalar neticesinde biyoremediasyon potansiyeline sahip 5 bakterinin saf kültürleri elde edilmiştir. Karakterizasyon sonucu ham petrolü parçalayan mikroorganizmaların, pseudomonas neustonica, bacillus licheniformis, corynebacterium stations, sphingobactrrium soli, lysinibacillus fusoformis türlerine ait suşlar olduğu belirlenmiştir. Elde edilen bakteri suşlarının petrol degredasyon etkisini görmek amacıyla GC–MS analizleri yapıldı. Analizler sonucunda örneklerde toplam 10 farklı bileşik elde edilmiştir. Bu bileşikler arasında alifatik alkoller, ketonlar ve kısa zincirli karboksilik asitler yer almaktadır. Elde edilen Kovats indeks değerleri 810-1813 aralığındadır. Bu sonuçların literatürdeki referans değerlerle büyük ölçüde uyumlu olduğu belirlenmiştir. C2–C5 aralığındaki kısa zincirli organik asitlerin mikrobiyal metabolizmaya işaret ettiği anlaşılmıştır. Pseudomonas neustınica bakterisinin 99,79’luk benzerlik oranına göre petrol biyodegradasyonunda daha baskın bir rol oynadığı belirlenmiştir.

This study was conducted to isolate petroleum degrading bacteria from crude oil contaminated soils, characterise them at the molecular level, and determine their petroleum degradation potential. Soil samples were obtained from Azerbaijan, contaminated with crude oil, and then studied. Bacteria isolated using laboratory procedures appropriate for bacterial isolation were examined using DNA isolation and PCR techniques for molecular identification following morphological and biochemical analyses. Furthermore, the effects of the bacteria on petroleum degradation were evaluated using spectrophotometric measurements. The findings reveal the potential of these bacteria in ecologically sustainable bioremediation approaches. As a result of the studies, pure cultures of five bacteria with bioremediation potential were obtained. Characterisation revealed that the microorganisms capable of degrading crude oil belonged to the strains Pseudomonas neustonica, Bacillus licheniformis, Corynebacterium stations, Sphingobacterium soli, and Lysinibacillus fusoformis.GC-MS analyses were performed to observe the petroleum degradation effect of the obtained bacterial strains. As a result of the analyses, a total of 10 different compounds were obtained in the samples. These compounds include aliphatic alcohols, ketones, and short-chain carboxylic acids. The obtained Kovats index values range from 810 to 1813. These results were found to be largely consistent with reference values in the literature. In particular, it was understood that short-chain organic acids in the C2–C5 range indicate microbial metabolism. Based on a similarity ratio of 99.79%, the Pseudomonas neustınica bacterium was found to play a more dominant role in petroleum biodegradation.