Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

• 1

• MakaleAçık Erişim2025/r/gumushane/14055
  Investigation of virulence factor genes and biofilm formation of antibiotic resistant clinical E.coli isolates

  Mumin, Yahye Mohamud; Yüksel, Gamze; Özad Düzgün, Azer

  Purpose: The aim of this study is to investigate the antibiotic sensitivity, presence of virulence genes and biofilm formation capacity of 90 clinical E. coli isolates. Methods: The presence of virulence genes in E. coli isolates were investigated by PCR. Ninety clinical isolates of E. coli were subjected to biofilm quantitative analysis using the semi-quantitative crystal violet staining method. Results: it was observed that the isolates were resistant to quinolone, cephalosporin, aminoglycoside, carbapenem and penicillin group antibiotics. The presence of virulence factor genes were observed in a total of 86/90 E. coli. The highest rate of fim (92.2 %) virulence factor gene was detected in the strains. Afa, pap, cnf, sfa, hly were detected in 30 %, 13 %, 13 %, 3.3 %, 2.2 % respectively. Also, 13 different virulence factor gene patterns were determined in 90 E. coli isolates. Of the 90 E. coli isolates whose biofilm-forming capacities were evaluated, 42 were found to have biofilm-forming capacity. Of these 26 (28.8 %) the weak, 12 (13.3 %) moderate and 4 (4.4 %) strong biofilm-forming. Also, statistical analysis was performed to investigate the relationship between virulence factor genes and biofilm formation, and none of the 7 genes analyzed showed a significant relationship with biofilm formation. Conclusion: since pathogenic E. coli is an important public health problem, investigating antibiotic resistance, virulence factor genes and biofilm formation in bacterial pathogens is important for better treatment options.

  • 
  İncele
• Yüksek Lisans TeziAçık Erişim2024/r/gumushane/21503
  Üropatojenik E.coli izolatlarında virulans faktör genleri ve biyofilm oluşumunun araştırılması

  Yahye Mohamud Mumın

  İdrar yolu enfeksiyonlarının (İYE) en sık nedeni üropatojenik Escherichia coli'dir (UPEC) ve önemli bir halk sağlığı sorunudur. Bu tez çalışmada idrar yolu enfeksiyonundan izole edilen E.coli izolatlarının antibiyotik duyarlılığı, virülans genlerinin varlığı ve biyofilm oluşturma kapasitesi araştırıldı. İzolatların %52.2 sefepim, %85.5 amoksisilin/klavulanik asit, %53.3 seftazidim, %26.6 nitrofurontoin, %56.6 sefiksim, %37.7 gentamisin, %53.3 sefotaksim, %32.2 sefoxitin, %55.5 sefuroksim, %44.4 piperasilin/tazobaktam, %93.3 ampisilin, %37.7 seftriakson, %48.8 tobramisin, %28.8 fosfomisin, %61.1 siprofloksasin, %64.4 levofloksasin, %58.8 sülfametoksazal/trimetoprim, %90 ampisilin/sulbaktam, %24.4 amikasin, %16.6 meropenem, %15.5 ertapenem ve %16.6 imipeneme karşı dirençli olduğu tespit edildi. 90 E.coli'de virülans faktör genlerinin (sfa, pap, hly, cnf, aer, afa ve fim) varlığı araştırıldı. Elde edilen sonuçlara göre toplam 86 suşta virülans faktör genlerinin varlığı gözlendi. En yüksek oranda fim (%92.2) virülans faktör geni suşlarda tespit edildi. %30 Aer, %28.8 Afa, %13 pap, %13 cnf, %3.3 sfa, %2.2 hly virulans faktör genleri suşlar arasında görüldü. Ayrıca 90 E.coli izolatında 13 farklı virülans faktör gen paterni belirlendi. Biyofilm oluşturma kapasiteleri değerlendirilen 90 E. coli izolatından 42'sinin biyofilm oluşturma kapasitesine sahip olduğu belirlendi. Bunların 26'sı (%28,8) zayıf, 12'si (%13,3) orta ve 4'ü (%4,4) güçlü biyofilm oluşturduğu görüldü. Ayrıca zayıf biyofilm oluşturan suşların afa, aer, cnf, afa+pap, orta derecede biyofilm oluşturan suşlar afa, aer ve cnf, güçlü biyofilm oluşturan suşlar afa, aer+pap, pap+sfa+cnf virülans faktörü genlerini taşıdığı belirlendi. Sonuç olarak, idrar yolu enfeksiyonu önemli bir halk sağlığı sorunu olduğundan, İYE ile ilişkili bakteriyel patojenlerde antibiyotik direnci, virülans faktör genleri ve biyofilm oluşumunun araştırılması daha iyi tedavi seçenekleri açısından önemlidir.

  İncele